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D3/3D
(Drug Design by Docking)


分子ドッキングシステムD3/3Dは、タンパク質の立体構造を基にして、低分子化合物(リガンド)との結合を予測するためのシステムです。立体構造データベースであるPDB (Protein Data Bank)のデータフォーマットに基づいてドッキング計算を行い、その結果出力されるリガンド分子の様々なコンフォメーションを表示します。また、PDB や配列の相同性検索を行うBLASTなどのインターネット上の資源と接続し、ドッキングシミュレーションに必要な情報の検索も行うことができます。


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